Tras varios años de investigación y excavación elemento del Instituto Nacional de Antropología e Historia encontraron restos de lo que podría ser una capilla contraída bajo las órdenes de Hernán Cortés.
Después de la toma de México/ Tenochritlan Hernán Cortés se estableció en Coyoacán, primer asentamiento español y donde Cortés ordenó construir una capilla en el pequeño templo, de la que posiblemente sean los vestigios hallados.
La Dirección de Salvamento Arqueológico (DSA) del INAH, registraron los hallazgos suscitados durante la investigación arqueológica en La Conchita, efectuada entre 2012 y 2014, derivados del seguimiento a los trabajos de restauración, recimentación y mejoramiento que tuvieron lugar al interior y en las inmediaciones del recinto religioso.
Los investigadores explican en videoconferencia que, en 1524, Cortés ordenó a los habitantes de Coyoacán, tierra llamada de Ecatempan, iniciar la construcción de la pequeña capillaprovisional, la cual fue edificada en poco tiempo con materiales perecederos, como madera, adobe y lodo, a diferencia de la ampliación y las modificaciones que se harían en los siglos XVII, XVIII y XIX.
Los restos de dichas construcciones conformaron un montículo que fue aprovechado en el Posclásico Tardío (1200-1521 d.C.) por los grupos tepanecas que se asentaron en la región, erigiendo sobre él una estructura que, a principios de la época novohispana, fue arrasada para edificar la parte principal de la Capilla de la Concepción.